文正國小前身蔴荳公學校寮仔分教場,創立於大正7年(1918)3月3日。
以下依年度述說:
1918年(大正7年,民國7年)3月3日:蔴荳公學校寮仔廍分教場(分校)借用寮仔廍區長役場,鄭品區長私家邸宅權充「學校教室」。
1921年(大正10年,民國10年)升格獨立設校:寮仔廍公學校,校址為寮仔廍364番地,寮仔廍與西庄交界處,曾文溪北岸。校長為日人「中島青榮」。
1923年(大正12年,民國12年)降格為:蔴荳公學校寮仔廍分教場(分校)
1941年(昭和16年,民國30年)奉准獨立設校:麻豆東國民學校,校長「平井高行」擔任,同年8月「校址」由「寮仔廍」遷移至「麻豆南勢」(現在校址)。
1945年(昭和20年,民國34年),日本戰敗,11月29日校長「平見時次」移交由「謝阿當」擔任校長。
1946年(民國35年)改名為:麻豆鎮第三國民學校。
1947年(民國36年)曾改名為「麻豆鎮南勢國民學校」(學校所在地命名),但為時不久又改回「麻豆東國民學校」。
1953年(民國42年)4月1日校名為:麻豆鎮文正國民學校,「陳達道」擔任校長。
1958年(民國47年)1月1日奉准於寮廍里附設幼稚班。
1962年(民國51年)9月1日奉准於本校增設幼稚班。
1968年(民國57年)8月1日校名為:麻豆鎮文正國民小學。
2008年(民國97年)8月1日奉令總爺國民小學與本校合併。
2010年(民國99年)12月25日校名為:台南市麻豆區文正國民小學(縣市合併升格直轄市)
2013年(民國102年)07月:購買台南市麻豆區文正段178-1地號
1、「麻豆文旦」的「文」,配以「正宗」的「正」---文正。
2、紀念清朝名將曾國藩「曾文正公」---文正。。
3、以「孫文、蔣中正」之名,各取ㄧ字---文正。
以上說法應屬第三種(紀念孫文與蔣中正)較為正確。